杀菌的主要对象是肉毒芽孢螺旋杆菌，此种菌能产生对人体造成致命伤害的毒素，其属耐热性厌氧菌，在121℃环境中三分将钟将失去生物活性，在100℃环境中6个小时左右失去生物活性。当然，温度越高，该病菌存活时间越短。121℃杀菌时，食品中心F值达到4，食品中就不会检测出肉毒芽孢螺旋杆菌，达到了商业无菌的要求。

所以对食品进行杀菌，温度一般都会控制在121℃左右，温度太高对食品的风味会产生不良影响。如果某点的温度低于平均温度，那么该点就不能达到预定的杀菌F值，这个点附近的食品就无法达到杀菌要求。这就要求杀菌锅内各点在升温时温度必须迅速达到一致，保持各点F值高度一致，这样才能迅速结束杀菌过程。降温也要迅速，大限度减少杀菌流程时间。

    喷淋式杀菌锅采用从设置于锅内的喷嘴不断的向被杀菌物喷射扇状，带状的波动式热水，热扩散快且热传递均匀。灭菌锅采用模拟温度控制系统，根据不同食品对杀菌条件要求，随时设定升温和冷却程序，使每项一种食品均可在最佳状态下进行灭菌，肉类熟食杀菌锅从而避免了同于高温高压灭菌方式下热损伤大的缺点。